События новой ленты разворачиваются сразу после того, как Марио вместе с Луиджи, принцессой Пич, Тоадом и жителями Бруклина отразили крупнейшее нашествие Боузера на их родной город. Враг был повержен, а водопроводчик получил заслуженную славу героя, но спокойствие длится недолго — за кулисами злодей тайно восстанавливает силы и выстраивает новые планы, которые оказываются куда масштабнее...
